Derzeit bieten in der Schweiz rund ein Dutzend Tankstellen reinen Biodiesel (B100) zum Verkauf an. Die Beimischung von 5% Biodiesel zu fossilem Diesel (B5) ist unproblematisch für das Fahrzeug und wird seit einigen Jahren auf dem Markt angeboten.

Im Jahr 2009 betrug die Biodieselproduktion in der Schweiz ca. 6.8 Mio Liter. Vermarktet wird Biodiesel vor allem über Agrola und Migrol. Aufschwung soll die von der Green Bio Fuel Switzerland AG in Bad Zurzach geplante Biodiesel-Produktionsanlage bringen. Diese soll künftig 130 Millionen Liter Biodiesel produzieren und somit den gesamten Biodiesel-Verbrauch der Schweiz abdecken (siehe Projekte Biodiesel). Allerdings muss hier der weitere Verlauf des Gesetzesentwurfs zur Erhöhung der Hürden auf Steuererleichterungen abgewartet werden.